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西南大学最近几天发布最新研究成果:家蚕基因组生物学国家重点实验室主任,国家蚕业产业技术体系首席科学家戴方银教授,完成了家蚕大规模种质资源的基因组分析,在国际上首次绘制了家蚕超泛基因组图谱,率先实现了家蚕遗传信息的数字化——数字家蚕。
家蚕是一种重要的经济昆虫和新兴的模式生物以前只有单一参考基因组和部分重测序,不足以支持基因组变异和优秀基因的深度挖掘,尤其是分子育种超泛基因组是一个物种所有基因组信息的总和,对于深化功能基因组研究和种质创新具有重要意义
家蚕的超级泛基因组图谱是一个涵盖了家蚕所有遗传信息的图谱通过这个图谱,我们可以直接对接表现型和基因组代码比如,以前识别特定性状的基因或因果变异就像大海捞针,现在就像瓮中捉鳖,因为超泛基因组为此提供了精细网格化的坐标指导,就像专家查字典一样
据西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室教授,博士生导师童晓玲介绍,研究团队对1078份家蚕种质资源进行了测序,其中包括47份野蚕,205份原蚕品种,194份实用蚕品种和632份突变体,并绘制了高精度的家蚕全基因组图谱这个超级泛基因组包含了家蚕和家蚕最全的基因组信息,是世界上动植物领域最大的长阅读泛基因组同时,团队还对家蚕的各种遗传变异,群体结构,人工选择,生态适应性,经济性状等进行了深入研究,取得了丰硕的创新成果
蚕起源于中国,由中国的野蚕驯化而来,有5000多年的驯化历史但其驯化起源是一个长期悬而未决的问题,尤其缺乏有力的生物学证据本研究中的材料显示了世界上主要蚕桑区最丰富的遗传多样性发现黄河中下游特有种在进化树上分布于蚕枝基部,说明蚕起源于黄河中下游